Район Купчино располагается в Приневской низменности, в среднем течении реки Волковки (южный приток Невы), второе название которой Сетуй. Этимология слова Сетуй не ясна. По одним данным, оно переводится с вепского как «светлый ручей», по другим как волчий ручей). В процессе жилого строительства в 70-х годах Волковка была заключена в Волковский канал, протекающий вдоль Витебской линии Октябрьской железной дороги.